林贤原是一位优秀的花剑运动员,曾荣获城运会三连冠。退役后在一家俱乐部作王牌教练,后因一起银行劫案成为见义勇为的英雄,并与所救周漪结为夫妻。正当二人为美好的生活尽力打拼,周漪又怀孕的关键时刻,林贤突感身体极度不适。一次与俱乐部新会员,美国灵勃生物基因公司中国市场总监连菲交手时被连连击败,引起老板张大平不满,只好挂剑而去,生活顿时陷入低谷。灵勃公司总经理田友是林贤生死患难的朋友,得知他的遭遇,加之公司急需一位平民英雄作形象大使,便力荐林贤出任。林贤摘桂,命运陡转声名鹊起,被媒体、鲜花追捧。不料祸起萧墙,林贤被查出是艾滋病患者,这对灵勃打开中国市场是一个致命打击。为了掩盖事实,美国市场部派来阿瑟实施让林贤消失的“蓝百合”行动计划,几股势力展开了真相与虚假,正义与邪恶的角逐。。故事以TV版为基础,战斗所剩下的骑士只有六人:城户真司、秋山莲、北冈秀一,浅仓威,雾岛美穗和一位神秘骑士。雾岛美穗成为假面骑士骑士的目的是要杀死浅仓为姐姐报仇,并让姐姐复活。 为了报仇的美穗不理真司的阻止,仍多次与浅仓战斗,却反而令自己陷入危机,当浅仓向美穗下毒手时,龙牙突然出现解救美穗,并以强大的力量将王蛇压倒 ,令美穗成功杀死浅仓。 由于美穗以为是真司救了她,便相约他出来吃东西希望报答他,而真司和美穗的感情亦得以发展,可惜这个美好时刻却被邪恶的假面骑士龙牙破坏。镜中世界的真司假冒真正的真司袭击美穗,美穗与龙牙战斗但处于下风,虽然美穗被真司所救,但最后因伤重而死…。