年轻检察官克里斯蒂安为人正直,因屡破要案赢得上级赏识,被最高检察官亲自安排调查一桩腐败案件。然而调查工作受阻,被控方莱卡拒绝认罪,已有证据也漏洞百出,上级却不停督促他结案。随着调查深入,克里斯蒂安逐渐发现了一张巨大的贪腐网,其涉及的部门和高官令他震惊。为了维护正义,他没有屈从上级的压力,毅然写出一份莱卡无罪的报告。结果可想而知,克里斯蒂被安被休假。出于法律工作者的良知,他继续进行调查。以往的领导请他看了一部“大片”,原来是克里斯蒂安接手案件后被跟踪拍摄的大量影像资料。接下来,官方通知他因受贿被立案调查,法学院的课程被他人替代,以往的博导拒绝见他。克里斯蒂安明白了自己不过是黑暗势力游戏中的一名棋子,他选择了以死抗争。送葬仪式上各色人等云集,最高检察官的颂扬之词令人啼笑皆非,好在多年后克里斯蒂安调查的贪官一个个被送上了法庭。。“闇之书事件”(参照魔法少女奈叶A's)的10年后。踏入19歳的高町奈叶、菲特·T·哈洛温、八神疾风三人,怀抱着彼此的友情牵绊、为了追求各自的梦想实现而加入时空管理局,并以一流魔导师的身分活跃。 在此当中,出现了新发现的太古遗产“圣遗晶石”(レリック),以及以此为目标而出现的谜样机械兵器“共鸣拓发者”(ガジェットドローン)。为了迅速对应日后被称为“圣遗晶石事件”的状况,八神疾风考虑到设置能够迅速对应的独立部队的必要性,设立了专责处理与太古遗产关连任务的特殊部队——“机动六课”。 另一边,时间回溯到四年前。昴·中岛在遭到机场火灾卷入而几乎丧命之际,由于奈叶的出现而得救。因为憧憬著如同“自己理想中的形象”一般的奈叶,昴在当晚的满天星空之下,做出了“成为管理局的魔导师”的决定。 四年后,经过一番波折而顺利成为管理局的新进魔导师的昴,与训练校时代的伙伴蒂雅娜...。