漁業飛行員月岡和小林在無人島上的石洞目擊哥斯拉和一隻背面長出長刺的怪獸正在打鬥。返回大阪後,二人立刻報告, 對策本部立即被成立,並查那一隻長刺的怪獸叫「安基拉斯」,又是和哥斯拉一樣受氫彈試驗而蘇醒, 山根博士在沒有兵器對抗哥斯拉的情況下, 建議用燈光誘導怪獸回海的方法。 在燈火管制下,大阪灣出現哥斯拉,防衛隊在灣外發射照明彈作誘導。可是,有幾位囚犯趁疏散時逃獄,他們搶了運油車。為逃避警方追捕,他們在大阪市中飛車,由於車速過快,運油車失控撞進工廠,引發大爆炸,壤成火災,以致哥斯拉向著大阪上陸。破壞大阪上的建築物,後來更在大阪城跟安基拉斯死斗,哥斯拉最後咬死暴龍安基拉斯,再以放射火焰把安基拉斯火化,哥斯拉回到海中消失身影。 轉了公司一起到北海道的月岡,在那裡與從前的戰友再次相見。在大阪消失身影的哥斯拉突然在北海道海上被發現。哥斯拉更在神子島上陸了,轟炸機...。在未来世界中,人类为获取另一星球——潘多拉星球资源,启动了阿凡达计划,并以人类与纳美人(潘多拉星球土著)的DNA混血,培养出身高近3米高的“阿凡达”,以方便在潘多拉星球生存及开采矿产。受伤的退役军人杰克,同意接受实验并以他的阿凡达来到天堂般的潘多拉星球。然而,在这唯美幽境里,地上爬的、天上飞的、土里钻的生物却只只巨大且致命……杰克背负重任,身处险境中,在与纳美人首次意外接触后,虽然开启了沟通的可能,却也即将面临一场异想不到、浩瀚壮烈的世纪冲突,从中他也将获得空前启示……。