民国初年,燕南大学考古系教授的秦羽偶得藏龙墓线索,立即着手准备组建考古队伍,墨班机关术传人韩阳身手不凡,遂邀请其参加考古挖掘。为筹钱二叔治病,韩阳不顾二叔的劝阻,答应同行。与秦羽相熟的地方军阀李大勋得知此事,主动资助考古。秦羽带韩阳、女儿秦卿、学生杨沫、罗子钦和李大勋之女李冰瑶组队出发。不料,江湖传言葬龙墓有一至宝龙珠,韩羽一行被另外两个盗墓团伙跟踪。经过跋涉,秦羽凭借蛛丝马迹已经接近目的地,却发现了大量的蛇蜕……。“医龙”再次归来!完成了日本第一例Batista手术收入后,由朝田龙太郎(坂口宪二 饰)率领的小队就被解散了。朝田回到了难民营,继续他的国际救援。之前任职的明真大学,格局也有所变化。前小组成员伊集院登(小池彻平 饰)、里原美纪(水川麻美 饰)等虽然还留守医院,但都因医院的情况精神不佳。
这时,一封不知来历的邮件发到了前小组成员的手上。邮件的内容是希望重组医龙小队。这个信息让小组的成员都感到既兴奋又忐忑。这时一位患者被送到医院,由龙太郎适时挽救了生命。借此机会,医龙小队又再次组建,一切都朝着好的方向发展着。但朝田似乎隐隐感觉着背后有人在操纵着这些事……。