在华北农村,佃户杨白老的女儿喜儿和青年王大春正在相爱。地主黄世仁看中了喜儿,设下圈套,逼杨白劳把欠他家的六斗谷子年前连本带利还清。杨白老拿一冬的血汗钱七块五毛到黄家还利,被逼本利全清,否则用喜儿抵债。并硬逼他在女儿的卖身契上按了手印,除夕夜杨白老含恨喝下卤水自杀了,初一悲痛中的喜儿被抢进了黄家,不久被黄世仁奸污了,大春配合张二婶搭救喜儿被发现,逃跑投奔了红军。后来二婶再次帮喜儿逃出了黄家,藏进了深山丛林里,喜儿靠捡奶奶庙的贡品和吃野果活命。非人的生活使喜儿的头发慢慢成满头白发。村子里有人看见,传说成收贡品的白毛仙姑。之后大春随部队回到家乡,展开减租减息运动,黄世仁利用白毛仙姑的传说企图动摇民心,为粉碎地主阴谋,大春带领乡亲夜间潜伏在奶奶庙,寻找白毛仙姑……。市立见泷原中学,又迎来平静祥和的一天。就读于二年级的女孩鹿目圆(悠木碧 配音)和朋友美树沙耶加(喜多村英梨 配音)、志筑仁美(新谷良子 配音)尽情讨论恋爱的话题,享受少女的快乐青春。这时班上转来了名叫晓美焰(斋藤千和 配音)的新生,这个带着些许神秘气质的女孩让小圆颇感疑惑。与沙耶加下学回家路上,小圆听到呼救声,声音来自一只浑身伤痕累累的未知生物,而追杀它的正是晓美焰。危急时刻,她们得到同为见泷原中学学生的魔法少女巴麻美(水桥香织 配音)的帮助,进而得知那只名叫丘比的生物有能够帮助人变成魔法少女的能力。少女们无意间开启了通往另一个世界的大门……
本片为魔法少女的剧场版,分三部上映,由TV版12话重新编集而成。。