一位神秘人物的出现让小镇上的居民终日生活在恐惧之中,他利用一架邪恶的机器制造出了许多可怕的怪物,将它们放到镇上为非作歹。这时,就轮到“秘密公司”的诸位出马了,可摩拳擦掌跃跃欲试的沙吉(马修·里沃德 Matthew Lillard 饰)和搭档史酷比(Neil Fanning 配音)却被告知留守公司,不必参加行动。
不甘心的沙吉决定和史酷比私下里调查事件的真相,以挽回他们一败涂地的名声,没想到却闹出了一大堆的麻烦。随着调查的深入,博物馆馆长帕特里克(赛斯·格林 Seth Green 饰)带着他的阴谋渐渐浮出水面,线索显示,这一切,很可能和传说中的恶魔复仇有着千丝万缕的关联。。里昂市长保罗感到很不安。在从政三十年后他发觉自己已没有什么新思维,感到非常空虚。他的团队决定聘请爱丽丝,一位才华横溢的哲学家来为他解决这问题。爱丽丝与市长因而展开一连串的对话,这让他们经常接触,并且动摇了他们的信念。问题也逐渐出现:政治和反思是否能够兼容?。《Beast Machines: Transformers》延续了前作《Beast Wars》的故事。Maximals在击败Predacons后返回Cybertron,却发现家园被Megatron统治,所有居民的火种(sparks)都被囚禁。Optimus Primal、Cheetor、Blackarachnia和Rattrap被迫变回兽形态,并失去了大部分记忆。他们在地下发现了Oracle超级计算机,获得了新的科技有机体形态。Maximals必须解放被囚禁的火种,揭开同伴Silverbolt和Rhinox的命运,并恢复Cybertron的有机生命。。