将施奈德回老家之后,四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人,于是不再像以往一样一起战斗,而是各自在喜欢的领域内钻研,以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”!
这时,纽约市中发生一连串的怪事。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意图征服纽约市,秘密培养了一支远古怪兽组成的军队,加上恶名昭彰的忍者组织Foot Clan,各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动!
神龟们又处于备战状态了!他们再次联合起来,准备向黑暗势力出击!。失忆的富家千金盛书然被傅老爷子所救,在其安排下与其孙傅铭辰结婚,二人结婚三年以来都分房睡。这天,傅铭辰被人下药回家,与盛书然发生关系时说的却是初恋沈沁的名字,盛书然死心,决定与傅铭辰离婚。。