繁华都市的苍凉一隅,破破烂烂的拆迁房旁边,鬓发斑白的老肖(吴坚 饰)独立经营着一个颇显寒酸的早点铺。老肖曾是一名在老山前线光荣负伤的英雄,回到家乡后,温柔的妻子和刚出生不久的儿子给他带来无限的自豪与喜悦。他的儿子肖大宝在很小的时候便展现出过人的天赋,其才能甚至引起国家领导人的关注。可惜,青少年时期的大宝(肖央 饰)却变成《伤仲永》似的人物,他整天打架、弹琴、泡妞,让爱之笃深的老肖丢尽颜面,羞愧交加。
在挨了父亲一次痛打之后,大宝选择离家出走。两代人的隔阂与矛盾,以及万里的路途,终究无法截断父子间那骨血中永世的挂念与牵绊……。在东京某个位于西国立市的神社内,有三名可疑的男子正在密谈。突然有个戴着假面具的黑影男人出现,他用日本刀和弓箭在瞬间将三人杀害。与此同时,在大阪、京都也相继发生了杀人事件。警方在经过调查后发现,被杀害的五人都是出没于东京、大阪、京都三地,专门偷窃著名佛像及艺术品的窃盗集团“源氏萤”的成员。这个集团以日本历史上最有名的悲剧武将——源义经的故事《义经记》为名,首脑化名“义经”,部下则以“弁庆”为首,各自以家将姓名相称。另一方面,小五郎带着柯南、小兰和园子来到了京都。八年前,位于京都的古老寺院——山能寺中的一尊国宝级佛像遭到偷窃,寺院的住持为了解读一幅可以判断佛像藏匿地点的谜样的画像,因而请来了小五郎帮忙,小五郎一行人展开了调查。。