人类对纳米机器人的研究进入到了最后时刻,就在这关键期,科学家发现一旦纳米虫进入复制阶段,人类将无法控制。但是一个掌握了核心技术的权威被富商收买私下研究,一直没有攻克一些软件技术上的难题。正在此时,张昊,一个研究纳米虫的天才出现了,成为权威张博翰的助理。可是这个助理并不老实,偷窥实验室的一些不准他涉足的地方。最后真相暴露,张昊是另外一家公司的商业间谍,专门来窃取张博翰的核心技术的。此时揭露出了一个惊天真相,张博翰用已经怀有身孕却已故的妻子实验了纳米虫技术,生下了一个完全纳米虫体质的女儿......。表面上看贝丝过得很好,但其实她想要过一个更真实的生活。。在距离地球15光年的外太空,科技昌明的Baab星上生活着一群爱好和平的蓝色小人。其中斯科奇(布兰登·费舍 Brendan Fraser 配音)是该星球一个勇猛果敢、正义感十足的超级英雄,他经常驾驶超新星-9号飞船穿梭宇宙,在BASA总部他的兄弟盖里(罗伯·考德瑞 Rob Corddry 配音)的指挥下,一次次圆满完成营救受困外星人的任务。这一日,刚回家不久的斯科奇被BASA负责人莉娜(杰西卡·阿尔芭 Jessica Alba 配音)命令即刻前往黑暗星球——地球执行救援任务。担心兄弟的安危,盖里与执意前行的斯科奇发生争吵。在全Baab星人民的注视下,斯科奇成功抵达著名的51区,结果却被夏克尔将军(威廉·夏特纳 William Shatner 配音)为首的军方抓获。 为了救回最亲密的兄弟,一向谨小慎微的盖里不得不踏上凶险的征途,而这一切背后的阴谋也悄悄浮...。