深町尚哉总是孤独一人。 自从八年前的青色灯笼祭典上见到去世的祖父之后,尚哉就有了分辨谎言的能力。 若对方所言为虚,声音将化为不可思议的刺耳奇声。注意到尚哉能力的父母由于恐惧而疏远,从此,他就独自一人拥抱孤独。 升上大学的他选修了「民俗学II」,负责这门课的准教授‧高槻彰良引起了尚哉的注意。 高槻教授说出的话语中并无谎言,声音听起来非常舒服。而这位高槻教授则是拥有瞬间记忆能力,只对世怪奇现象感到兴趣…。 拥有瞬间记忆能力的准教授‧高槻,与能分辨他人谎言的大学生‧尚哉, 将一起解开这些怪奇现象之谜!。20世纪末,世界各地的天才少年组成了一个名为"炼金之星"的组织,其成员之一的高山我梦作为"XIG"的一员,靠大地给予的红光变身成盖亚·奥特曼后,投入了同CRISIS计算机所预测到的"根源性毁灭招来体"进行的誓死决战中;另一方面,已脱离"炼金之星"的"藤宫博也"坚定地认为:对于地球而言,人类才是真正的癌细胞。他凭着"蓝光"的威力,变身成与"盖亚"相对立的"蓝色奥特曼--阿古茹·奥特曼"。作为日本平成年度奥特曼三作品的压轴戏,盖亚·奥特曼其最大的变化在于"盖亚和阿古茹"这二个敌对、且都为地球人出生的"人类奥特曼"的登场。当然,他俩的战斗场面也属前所未闻。同时,二人的对立观点贯穿前半段,因此前半段贴近于连续剧。