近未来,日本政要为了推进社会的发展,宣布正式开启提升智能机器人研究水平的“ARK计划”。秉承着一颗正直之心的光明寺信彦博士参与其中,谁知相关负责人竟然假借“ARK计划”名义意图开发军用机器人。在此之后,光明寺博士不明不白死于事故,身后留下了正上大学的女儿美津以及还未成年的儿子小胜。某个夜晚,姐弟俩遭遇一伙不明身份之人的劫持,危机时刻一名神秘男子出手相助,随后该男子竟然现出战斗机器人的模样,他就是光明寺博士生前专门安装了良心回路的智能机器人次郎。
光明寺姐弟的命运由此和次郎搅到一起,而更大的危机和阴谋正向他们逼近……。因为父母得了传染病一夜之间双亡,变成孤儿深受打击的九岁的美亚丽(富永美伊奈 配音)从出生地印度,做船来到了英国舅舅家中。舅舅的家在荒野的郊外,是一个特别大而神秘并且阴森森的庄园。舅舅是个古怪的人,美亚丽来了也不见她,也不能去找他,更不能随便到别的房间里去。在家的时候被父母娇惯的美亚丽,在这里女管家梅朵茹对她管教很严厉,她非常思念自己的妈妈。唯一从家里带来的小猫吧唧陪伴着她。美亚丽发现了座有围墙没有入口的秘密花园,每天夜晚都能听到里面有人哭泣的声音,美亚丽的猫吧唧因被老师发现了,被管家梅多茹赶出了家,半夜还没睡觉的美亚丽在伤心时又听到了哭声......。