在人类与恐龙共同生活的现代社会,每个孩子身边都会有一头小恐龙,成为驯龙斗士是每个孩子的梦想。
心奇四人因为意外掉进时空之门,回到了恐龙时代。他们发现这里遭受着外星侵略者魔甲族的入侵。原来魔甲族首领索罗斯盯上守护恐龙世界的“龙魂水晶”,为了得到它们而来到地球,奴役恐龙四处寻找和挖掘龙魂水晶。一旦龙魂水晶被拿走,恐龙世界会爆发大灾难,恐龙将会灭绝,现代社会的恐龙也会消失。
因此上古龙神打开了时空之门,把心奇四人以及他们的恐龙伙伴从现代召唤过来,希望借助他们的力量击败魔甲族。
为了击败魔甲族,守护恐龙,拯救世界,心奇四人踏上了一段冒险之旅……。吴越是顶级计算机天才,现实里被父亲认作是一个网瘾少年的差生。被养母儿子陷害,送进网瘾医院治疗,受到院长杨国袁的迫害,身死,却意外重生。重生以后,他焕然一新,决定撕开继母和其儿子的真实面目,将网瘾医院的骗局公之于众。。令人感到十分讽刺的是,假面骑士灭亡迅雷再次成为了人类的敌人。
哉亚日本公司发生了大规模爆炸事件,而罪魁祸首竟然是灭亡迅雷站?面对新闻发布会上记者的质问,刃唯阿表示暂不做任何回应。上级也在不断施压,假面骑士巴尔坎(不破谏)与假面骑士瓦尔基里(刃唯阿)不得不做出抉择。
理解人类和修码吉亚两方立场的不破谏与刃唯阿,都有各自的坚持,是为了守护所有生命而战?还是为了自己的规则而战? 他们与假面骑士灭亡迅雷之间的战斗究竟结果如何——!?。