该片讲述了双胞胎姐妹如花和如玉一家,由于三峡工程的需要,被政府统一移民安置到东台市学习和生活的故事,爸爸妈妈因为有事要很迟才到东台,奶奶带着如花和如玉先到了东台,但奶奶由于过度思乡出现了精神障碍,如花和如玉决定每天留下一人照顾奶奶,另一人上学。但两人不同的性格让不知内情的小伙伴们诧异不已,于是相约跟踪调查。“心怀鬼胎”、“田边密谋”、“鬼祟跟踪”……行动暴露却穷词诡辩,“三个火枪手”将小孩子的多变习性、淘气可爱演绎得淋漓尽致。。正值万圣节之际,东京涉谷热闹非凡。涉谷HIKARIE大厦里正在举办一场婚礼,身着婚纱的便是——警视厅的佐藤警官。当柯南等宾客都在见证这场婚礼的时候,突如其来的暴徒向佐藤扑去!高木为了保护佐藤而受伤,好在性命无忧。可这时映入佐藤眼里的,是三年前爆炸事件松田阵平殉职时出现的死神的幻影,这一次出现在了高木的身上。
与此同时,那场连续爆炸事件的犯人越狱了!这是巧合吗?
这个犯人同时也是公安警察降谷零(安室透)宿命的敌人,因为他害死了自己的同学松田。在即将追到犯人之际,突然出现了一个神秘的变装人物,给安室装上了项圈炸弹。为了解除项圈炸弹,柯南赶到了安室潜伏的地下避难所。柯南从安室口中得知了另一桩事件——三年前,安室和警校同学(现已亡)在涉谷遇到了身份不明的变装炸弹犯「普拉米亚」。
然而这时,危险已经开始笼罩搜查中的柯南等人……。