内向少女方晓萤从小就是容易被忽视的存在,有一天她发现自己被所有人遗忘,变成了一个完全透明的人。绝望之余,她偶然发现只有曾经有过误会的校草余之昂才能看见她。二人达成契约,余之昂帮方晓萤答应重新找回自我,两人在“双向守护”中互生好感,而方晓萤也逐渐找回自信。然而有一天,余之昂却发现自己看不见方晓萤了……。20年前,奥特兄弟为了阻止由异次元人亚布鲁怨念衍生出来的终极超兽奥特杀手萨乌鲁斯,奥特兄弟用尽了所有力量和萨乌鲁斯进行了一番苦战。最后,奥特杀手萨乌鲁斯被打败,沉入了神户港的深海。亚布鲁的怨念得以被封印,但是,奥特兄弟们也丧失了变身的能力。
梦比优斯奥特曼来到地球半年后,隐约感觉到了神户的异样并独自一人去前去调查。梦比优斯奥特曼得知传说中的奥特兄弟作为人类,在神户生活着。此时,由多位外星人组成的宇宙联盟为了解开当年封印,也来到了地球。为了使沉睡在神户深海的奥特杀手萨乌鲁斯复活,宇宙联盟决定先铲除可能成为最大阻碍的梦比优斯奥特曼。光之国的佐菲向地球上的奥特兄弟们发出了奥特签名,提醒他们要小心宇宙联盟。
一场正邪之间的较量再度展开......。吉儿某日回到家发现妹妹茉莉突然无故失踪,种种迹象让她深信是之前曾经绑架过她的歹徒再度找上门来!上次她逃过一劫,然而这次因她不在家,却害妹妹成为无辜的替代品。吉儿确信歹徒是冲着自己而来,因为只有她曾经历过在树林的深洞里的恐怖回忆,只有她知道歹徒的秘密!
吉儿深信茉莉极可能有迫切的生命危险,她急着向警方求助,且坚称这与上次企图绑架她的是同一人所为。但警方并不相信她的话,因一年前她被丢在树林中被人发现,宣称她被绑架且与其他女孩们一同囚禁在某个深洞里。然而警方根据她的供词进行搜索,却完全找不到任何可疑的人事物,也找不到她所说的深洞,一切似乎只是她虚构出来的幻想……
警方认为凶手并不存在,茉莉只是一时失联应该很快就会回家,对吉儿的报案并不认真当一回事,但吉儿知道茉莉可能很快就会遭遇不测,心急如焚的她只能靠自己的力量,这次她必须再度跟她不愿面对的梦魇周旋。然而只剩12小时了,究竟一切只是她不正常的幻想还是真有其事?她是否还来得及救出亲爱的妹妹?她决定不顾危险自己一人去追查真相,所有答案再度指向那片树林静处,无人知晓的神秘深洞里……。