陶涛(李晨饰)是武警九中队里的一名“问题学生”,在押运任务中屡屡犯错,但中队长邵笛(王斑饰)发现了他内心的闪光点,因此对他格外重用。陶涛的父亲患上了尿毒症,他的弟弟陶锐为了筹钱医治父亲,被犯罪分子利用,设计了一个抢劫银行的软件,得知此事的陶涛尽管十分痛苦,但还是大义灭亲,将弟弟送入了牢房。 项洛阳是邵笛的大学同学,如今已经一跃成为了公司老板,因为经营不善,项洛阳负债累累,于是设计诈保。徐晓菲是陶涛的女友,陶涛怀疑她的父亲正在干某种违法的勾当,于是决心独自调查,却被对方发现打晕。犯罪分子们将目标锁定在了金库之上,所幸陶涛及时醒来,保住了金库的财产。。突袭世界的大灾难“第二次冲击”后,世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他,却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下,特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下,并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的,却是是父亲冷酷地命令:驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。
本已表示拒绝的真嗣,看到重伤的替补驾驶员绫波丽后,决定遵从父亲的命令。就这样,从未受过作战训练的真嗣,准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
世界的命运托付在了一位年仅14岁的少年身上,而“第二次冲击”所隐藏的“人类补完计划”似乎也开始了行动。掌握一切答案的碇元渡,却只是不动生色地观察,仿佛一切早已写入剧本。。