《天堂计划》的故事架构在一个资源匮乏的近未来世界,人类赖以生存的资源开始变得枯竭,同时环境越来越差,人类细胞自我修复能力降低,2/3的人患有血液疾病面临因器官衰竭带来的死亡,克隆人器官贩卖市场滋生,政府为最大限度地解决生存资源不足而实施了“天堂计划”,将重病或者年满60岁的人类意识上传,成为“虚拟人”。杨晓和杨蔓是天堂计划的基层执行者,但是一场虚拟人失踪案,俩父女因此被卷入了这场危机之中。。故事发生在大正十五年,多吉(长冢京三饰)不愿意继承家业因而离家出走,前往静冈县投靠在印刷厂工作的大哥。途中,多吉邂逅了名为大冢花(田中美佐子饰)的美丽女子,被大冢花的美貌所吸引,多吉改变了自己的目的地,追随在大冢花的身后。 实际上,大冢花是依靠身体赚钱的妓女,多吉于无意之中窥见了大冢花和一个男人的交易,不明就里的多吉以为大冢花遭到了强暴,遂起了杀心。之后,男子的尸体被警方发现,和他有牵连的大冢花遭到了拘捕调查,却因为证据不足而被释放。一晃眼二十九年过去,多吉已经成为了印刷厂的老板,而过去杀人事件的阴影却依然笼罩着他。。