民国初年,军阀罗蛮子得到了一只麻姑玉枕,便惦记上了棺山古墓,不惜四处拉壮丁强行开墓盗宝。退隐多年的张三爷,应师弟赫老鬼之邀,与徒弟二人奔赴龙塘乡。两个徒弟不忍珍宝被罗蛮子夺了去,于是夜访大帅府偷出了玉枕。张三爷无奈之下答应了赫老鬼的请求,想赶在罗蛮子之前找到麻姑墓,将墓中珍宝转移。可这场行动的背后,竟是赫老鬼与罗蛮子精心布置的陷阱……。故事以15年前的北大西洋上一件海难作序幕,这宗海难是由一艘在深夜浓雾中航行的货轮引起的。由于未能及时发现航道上有巨大冰山,货轮猛烈撞上冰山后导致引擎室受到重创,整艘船也在不久后彻底沉没。虽然大多数船员顺利获救,但船长与一名船员还是不幸罹难。
而在15年后的东京大都会,大财团的著名设计师在驾车时,突然心脏病发作。连人带车冲向山谷,车子在坠落山谷后起火燃烧,设计师当场气绝身亡。这两宗分别发生于两个不同年代的意外居然是一场惊天大阴谋的序幕。
幕后黑手选择了豪华邮轮“爱芙罗黛蒂号”作为展开阴谋的地点。恰巧江户川柯南、毛利兰、毛利小五郎等人参加了这艘邮轮的首次航行仪式,他们将一步步揭开幕后黑手的阴谋,让真相水落石出。。普通高考落榜生黎簇意外被袭击后被卷入一个以世界现状为目的的庞大计划中。然后认识了这一切的幕后布局者,以旅行摄影作家关根身份登场的吴邪,成为吴邪沙海颠覆计划的关键人,而吴邪利用九门禁地古潼京,谋划出清肃九门摧毁汪家的反击计划。吴邪已收敛起当年的天真,以他非同常人的智慧,开始向几千年前就被设定的命局宣战。。