在丛林里的一次秘密军事实验中,机器人欧米加一号突然失去控制,摧毁了指挥他的直升机。科学家马舍受命与一个特别行动小组进入丛林,寻找机器人。以布莱克为首的,代号“巴姆”的小组被马舍蒙在鼓里,贸然闯入了丛林。组员在与欧米加一号的交战中相继丧命,马舍在临终前终于吐露了实情,然而布莱克能够以一人之力战胜无坚不摧的机器人战士吗?在与欧米加一号的殊死搏斗中,布莱克却看到了曾经熟悉的眼神…。故事发生在一年战争期间,正和初代高达的故事平行。到地球战线赴任的年轻联邦军官斯罗·亚玛达,在一次偶然的交火中,结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人,因为正属于敌对的两方,所以不得不互相战斗,在战争中苦苦维持自己的感情;另一方面,斯罗和他所带领的、第08MS小队的队员们,也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。。