《那条河》主要通过年轻女孩许小苇丧母后寻父这条线,追述上个世纪六七十年代淠史杭工程修建时,一对年轻男女之间感人肺腑的爱情故事。许小苇是一名庐剧演员,但她一直觉得自己并不喜欢因母亲之愿而去学习的庐剧。一天,男友乔森因为家人反对他与单亲家庭的女孩恋爱而提出分手,让她伤心不已。之后,终于因为庐剧和母亲瞒着她独自前往乔森家求和,许小苇的情绪被引爆,她与母亲大吵一翻后夺门而出,却不想从此与母亲阴阳两隔。充满悔恨的许小苇在收拾母亲遗物时发现一个旧盒子,里面放着母亲珍藏的一张自己年轻时和一个男人合影的旧相片。一个又一个疑问浮出:这个男人是她的父亲吗?如果是,为何到现在自己都不曾见过他来寻找她们母女二人?当初他与母亲之间到底发生了什么?带着照片和这些疑问,许小苇踏上了追寻真相之路。。威廉被派到上海去調查斯芬克斯保險公司的一樁偽造證件案,由於他染上了一種奇特的病毒,使他能夠一清二楚地知道嫌疑犯的心理活動。瑪麗婭是斯芬克斯的雇員,這家公司發行一種特殊的證件「papelles」,這是保險、護照與信用卡的混合體。沒有這種證件的人就只能生活在被指派的次等區域內,那裡條件極其惡劣,基本就是沙漠般的荒地,這些低等公民被禁止進入文明地帶。 經過調查,威廉發現正是瑪麗婭在把偽造的證件賣給那些斯芬克斯公司拒絕與之交易的人。他很明白把瑪麗婭交給組織是自己的職責,但是似乎還有一股更大的力量在悄悄發生作用。威廉深深地愛上了她,他無法就此一手將瑪麗婭送上絕路。 事情甚至更復雜,最令威廉驚訝的是,瑪麗婭竟然是從他死去的母親腦部DNA克隆而成。 這對情侶受到驅逐,為了躲避當局追捕,他們不得不亡命天涯……。