2008年――謎の勢力の出現により、 アニメ、ゲーム、マンガ、音楽、鉄道、コスプレなどあらゆるオタク文化が排除された日本。 グッズは収容され、保護の名のもとにオタクが弾圧されても、 人々は自我を喪ったかのように疑問を持たない。 秩序維持を担う組織「SSC」に蹂躙され、オタクは滅びたかに思われた―― だが、封鎖されたアキバを奪還し、反旗を翻す者たちが現れる。 若き革命者「オタクヒーロー」――何よりもオタク文化を愛し、誰よりもアキバを愛する男。 そして彼を慕う3人の魔法少女たち――「アナーキー」「ブルー」「ピンク」。 2011年の日本を舞台に、自由の旗のもとに集ったオタクたち―― アキバ革命軍は、SSC首領「SHOBON」との壮絶な戦いに挑む。 混沌も秩序も破壊して、好きなものを好きなだけ好きといえる世界のために。 自由の旗のもとに集ったオタクたちよ、 ...。物語は閑静な住宅街にある赤い屋根の家から始まる。18年前、この家で両親を殺害し遺体を切り刻んだのは、実の娘の青田彩也子と、その恋人・大渕秀行だった。大渕は裁判中に「早すぎた自叙伝」を出版し、過去に女子児童を手に掛けたことを告白する。裁判では彼に洗脳された彩也子が凶行に及んだとされ、主犯の大渕は死刑、彩也子は無期懲役が確定。それから数年後、「早すぎた自叙伝」を担当した編集者・橋本涼のもとに、新人作家の小椋沙奈が、事件をモチーフにした小説の企画を持ち込む。小説の連載を実現すべく、大渕と獄中結婚した大渕礼子や、大渕のかつての愛人である元敏腕編集者・市川聖子ら関係者への取材を進める橋本と沙奈。しかし2人はやがて、関係者が抱える嫉妬や劣等感などの黒い感情に引きずり込まれていく。。