扣人心弦的《血色星期二》第二部再次席卷而来。天才黑客高木藤丸(三浦春马 饰)这次又会遇到什么棘手的问题呢?
第一部的最后,藤丸和其朋友力挽狂澜地阻止了病毒危机。而这次他们面临的则是更加令人恐怖的核弹恐怖计划。在病毒危机结束后两年,受其影响的藤丸决定再也不碰电脑,可是他还是不能组织自己和朋友九条音弥(佐藤健 饰)、高木遥(川岛海荷 饰)被卷入到新的计划当中。载有核弹的飞机正在一点点向东京逼近,而东京的群众却毫不知情,为了避免东京遭受到核弹的重创,藤丸和音弥不得不继续开始奋战。而他们所面对的除了老对手折原玛雅(吉濑美智子 饰)和神崎润(成宫宽贵 饰)外,还有许多新人。而结果究竟如何呢?。女娲使用光明之土造出了率真善良,豪爽正义的龙娃。又用光明之水造出了英姿飒爽,温柔可爱的凤娃,龙娃和凤娃视女娲为他们的母亲。天空中出现了巨大的黑洞,整个人界即将面临灭顶之灾,女娲煮化了五色石,试图填补漏洞,却将龙娃和凤娃也封印在了天上,从此母子被迫分离。伤心的女娲日日思念自己的孩子们,流出的眼泪汇聚在大地之上成为了黄河。
一晃眼百年过去,人间遭到了邪恶势力的侵犯,而女娲亦被困在绝世界中,对一切都无能为力。就在这个节骨眼上,龙娃和凤娃在天界习得了一身好本领后踏上了寻找母亲的旅途,一路上,等待着他们的是强大而又邪恶的敌人们。。