马塞尔(布鲁诺·克雷默 Bruno Cremer 饰)成长在一个破碎的家庭之中,父亲离开了他,他和母亲过着相依为命的生活。为了养家糊口,马塞尔跟随着母亲搬到巴黎郊区的一个街区中,母亲整日忙于工作,留给马塞尔的只有无穷无尽的孤独。 马塞尔和母亲所在的,并非一个太平的社区,这里处处充斥着暴力,洋溢着犯罪的气息。一次偶然中,马塞尔结识了名为让(弗朗索瓦·尼格雷特 François Négret 饰)的男孩。让是一个终日游手好闲的小混混,在让的耳濡目染之下,马塞尔渐渐走上了歧途。刚开始孩子们只是小偷小摸,渐渐的,事态开始向不可控制的方向发展。。故事发生在日本的江户时代,一名神秘的男子出现在了武士桂小太郎(石田彰 配音)的面前,他手握妖刀“红樱”,要求试刀,这个夜晚之后,桂便下落不明。桂的宠物伊丽莎白(高松信司 配音)找到万事屋的神乐(钉宫理惠 配音)和新八(坂口大助 配音),委托他们寻找主人的下落。同时,银时(杉田智和)也受到委托,寻找四处作恶的红樱的下落。三人的线索汇聚到了一艘空中飞艇上,由于远离警察的管辖范围,飞艇里的恶势力一手遮天。在那里,银时遇见了曾经的战友现在的对手高杉晋助(子安武人 配音),高杉正带领着自己的鬼兵队企图毁灭江户。一面是穷凶极恶的恐怖分子,一边是暴虐嗜血的妖刀红樱,身受重伤的银时能够平安脱险拯救江户吗?
此次剧场版重制了《银魂》动画中的《红樱篇》,其中,在原作中未出场的真选组也将在故事中大显身手。。