麒麟先生的故事讲述一名在动物园做文职工作的普通上班族,在城市里生活,身边遇到各种各样人物的故事。虽然城市给人一种独和疏离的感觉,但是每个人的交集,都会产生出一丝丝小小的温情。
麒麟先生是一个工作了有些日子的通上班族长颈鹿,因为喜欢动物所以应聘了一份动物园的工作,结果却是在办公室做文职,没什么机会看得到动物。因为家住得远,上下班都要坐地铁。虽然工作烦闷,容易被生活的琐事所困扰。但是麒麟先生总是能从中找到乐趣。另外看动物和喝奶茶都可以把烦恼通通忘掉。麒麟先生就这样一直平淡的生活,直到……。享保6年,将军吉宗下令设置了「意见箱」,藉由投递至意见箱的投书而设立了「新中町奉行所」,又名「虫奉行所」!为了保护人们免于遭受盘据江户的大虫所害,被选出的强者们大显神通,继承父亲的志向来到江户的菜鸟同心.月岛仁兵卫!然而他还不知道虫奉行所令人惊讶的工作内容……。