未来世界,人类文明高度发达,智能机器人大量涌现,已在日常生活中占据重要的位置,而且人类为了获得永恒的生命,也尝试将自己改造为机器人。同时,一列名为“银河铁道999号”的宇宙列车担负起连接地球和宇宙文明的使命,星系从此不再遥远。
少年星野铁郎(野沢雅子 配音)的母亲被嗜好杀戮的机械伯爵杀害,他肩负母亲的嘱托,决定前往安达罗星云改造身体,为此不惜在车站抢夺他人的银河铁道999号车票,不过也因此邂逅了容貌与母亲极其相像的梅蒂尔(池田昌子 配音)。凭借梅德尔的帮助,他终于踏上999号列车,继而展开一段充满未知的旅程……
本片为《银河铁道999》第一部剧场版动画。。汤姆(布鲁斯·威利斯 Bruce Willis 饰)出生于警察世家,他与父亲文森特(约翰·玛哈尼 John Mahoney 饰)不仅同为警察,两人还经常作为搭档一同执行任务。在一次意外中,文森特不幸身亡,父亲的死让汤姆感到了深深的愧疚,他陷入了自责和悲伤中无法自拔。 一起连环恶性凶杀案件的发生让整个匹兹堡陷入了恐慌之中,通过种种线索的调查,汤姆坚持认为凶手系警方人士,汤姆因此而遭到了业内的排挤和降职。时隔两年,类似的凶杀案再度发生,对案件依旧耿耿于怀的汤姆决定独自调查此事。随着调查的深入,汤姆惊讶的发现凶手竟然和父亲的死有着千丝万缕的联系,而汤姆的一举一动,似乎都在凶手的掌控之中。。在加洲沙漠深处的一个警察局,警察带回一个流浪者,流浪者拒绝说话,甚至不愿说出他的名字,他身上没有任何身份证明,只有一些零钱,一张报道当地一个警察英勇事迹的破旧剪报和一瓶药丸。警察以为他有精神问题,召来一个医生,医生鉴别出药丸是给透视人抑制他们透视能力的药物。但是,这个新囚犯用他的透视能力控制了警察的思想并杀死了他们。透视人开着巡逻车逃离。当警官萨姆获知这件事,他马上知道火车上的尸体是谁干的。他开始全面的攻击以捕捉这个无法无天的透视人。。