科学家本隶属于美国政府某个秘密部门,他通过高科技手段训练豚鼠说话与思考,并将它们培养成特工人员。然而,本的部门却面临被FBI关闭的局面,为了证明他和豚鼠特工的能力,本向豚鼠特工队的负责鼠达尔文下令,要它们潜入赛博林工业的CEO罗纳德·赛博的办公室,寻找罗纳德向中东国家出卖可用于军事的高科技芯片的证据。达尔文毫不怠慢,带着布拉斯特、华蕾斯、苍蝇莫奇和斯贝克斯等成员迅速展开行动。
这群豚鼠特工队员体型虽小,却身怀绝技,它们成功闯入罗纳德的办公室,并下载到重要资料。然而,这场冒险才刚刚开始……。这一季的故事依然围绕着泰德等五人展开。时间流转到2009年,相恋多年的马修(杰森·席格尔 Jason Segel 饰)和莉莉(艾丽森·汉妮根 Alyson Hannigan 饰)结婚后搬进了新的公寓,过着幸福甜蜜的小日子。他们最好的朋友泰德(乔什·拉德诺 Josh Radnor 饰),在上一季屡次碰壁之后,他决定放弃继续当建筑师,而改行做一名大学教授,同时,他也在努力地找寻自己的真爱之女。
而另一方面,他们共同的好友巴尼(尼尔·帕特里克·哈里斯 Neil Patrick Harris 饰)和罗宾(寇碧·史莫德斯 Cobie Smulders饰),在经过了一年的情感挣扎与斗争,他们终于搞在一起了。莉莉对此感到相当开心,但是巴尼、罗宾二人却难以定位彼此之间的关系。在三个好友的帮助下,他们能不能确定男女朋友关系?。