《剧场版 再见了假面骑士电王 最后的倒计时》为《假面骑士电王》的剧场版,2008年上映,故事描绘了假面骑士电王的最后一场战斗。
桃塔罗斯一行人结束了与异魔神们的战斗,终于过上了悠闲的生活。但最近,街头巷尾盛传,出现了一辆神秘的幽灵列车。叶奈与桃塔罗斯等4位异魔神一起出发寻找,却遇上了遭到绑架的良太郎。在敌人凌厉的攻势下,前来帮忙的侑斗身受重伤。这时,新一任假面骑士电王搭乘着崭新的时空列车前来力挽狂澜!混战中,桃塔罗斯找到了机会和良太郎对话。于是,以良太郎所言——“保护象”和一张车票为线索,桃塔罗斯一行人坐上时间列车,驶向300年前的过去……
究竟是谁绑架了良太郎又迫使他变身?又是谁在暗中策划扭转生死、篡改历史的阴谋?面对可怕的新敌人,良太郎与幸太郎携手,展开了最后的战斗。。欢宜寨怪病横行,守山人长生在奚长老的指点下为寨民们寻找药草,但是此举低效且危险,于是长生决定寻找传说中的九色鹿王拯救寨子;此时大月国中,妖后乖离控制王宫,为了修炼邪术而探寻九色鹿王的踪迹,太子延颐为了阻止妖后,也毅然踏上了寻找九色鹿王的道路。长生、延颐以及索命雕的猎人小队等几方人马奔涌至鹿王踪迹的第一个线索——鬼火森林。长生与延颐在危难中成为同道好友,但是不等他们找到鹿王所在,便遭遇妖后追杀,知道了妖后骇人听闻的图谋。
长生和延颐一路与偷猎团队斡旋,还要躲避妖后手下无魂尸的追杀,同时,二人在小藜等人的帮助下过五关斩六将,成功赶在所有人之前探寻到九色鹿王的秘密,并感化妖后,拯救了欢宜寨和大月国。。