年轻有为的催眠师正在给一个柔弱的女孩催眠,女孩在梦境中却意外遭遇不幸。醒来后,女孩意识混乱。催眠师解释,催眠中发生的事,有可能是脑海深处埋藏的记忆,也有可能是一种预兆。女孩带着困惑离去,却发现一切只是开始。。故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天,因意外一名外星人从宇宙坠落。失去过往记忆的外星人“奥美迦”化身为地球人模样,被人称为“宙人”。他对人类充满好奇,积极地接触这些陌生的生命体。
当神秘巨型生物接连出现时,尘封的记忆碎片被唤醒,宙人脱口而出“怪兽”二字。面对怪兽的威胁,强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼,与怪兽作战。
随着故事推进,来自外星的宙人与一位普通青年逐渐成为并肩作战的伙伴。。