明朝嘉靖年间,嘉靖皇帝求仙炼丹无心朝政,奸臣严嵩独揽朝政勾结祸乱。京城朋党林立人人自危,东南沿海倭患尤甚猖獗一时。虽有戚继光、俞大猷奋力抗敌平息倭患,但溃败的倭寇趁朝政不举天下大乱,勾结恶霸汉奸,流窜于江浙一带,致使民间百姓深受其苦。 在浙江某府,流窜倭寇一夜杀尽万朝观,穿上道服假扮道长,于观内后堂暗设机关,专门暗算前来求签算卦的小姐夫人。一时间,坊间失踪的小姐夫人多达数十人。江浙倭患惊动朝廷,嘉靖皇帝颁旨,着柳远山为钦差大人,以监粮为名,暗查镇南王与倭寇勾结篡乱之事。 柳大人带府内护卫石头秘密前往江南,千金小姐柳飞燕因思念石头尾随而来。柳大人下榻钦差府不便露面,石头拜访天下镖局,请来同门师弟王天虎,以天下镖局走镖为名,暗中进入万朝观。柳飞燕不知其中秘密,任性行由险些落入倭寇于观内后堂设下的机关暗窟。 此行万朝观,柳大人断定万朝观就是祸害失踪小姐夫人...。心情沮丧,愤世嫉俗的联邦调查局人员艾特杰菲(布鲁斯威利),由于调职后被人陷害,于是对政府失去了信心,这时他被派去调查一起双亲离奇遇害,男孩失踪的案件,可是被卷入了一场意想不到的事件。
杰菲在前往现场查案时,发现了失踪的男孩,这名患有自闭症的男孩“塞门”因为惊吓过度,不能说话,他的经历引起了杰菲的共鸣,凭他的直觉,他认为身陷危险,于是请求警方提供保护。但警方无故撤退了,杰菲只好带着孩子逃命。
杰菲不顾同事的反对收容了男孩,后来发现“塞门”竟然无意破解了军方最高机密的“水星密码”,于是惹来了杀身之祸。这个密码是为了保护美国在全球的情报活动,于是杰菲被逐出联邦调查局,向警方的求助也被拒绝,只好单枪匹马保护“塞门”,摆脱政府的追杀。。