近未来,S组织已经掌握了基因改造技术,他们制造超级士兵,以此来改变世界格局。而其中初代的基因改造战士“巽狼”于实验中发生意外,他回想起已经被删除的片段记忆,曾经的名字“乾武”。于是他从S组织逃离,去寻找丢失的记忆。
在躲避组织的追杀过程中,乾武逐渐回想起了自己的过去,并通过寻找家人等一系列冒险的经历,最终找回真正的自我,完成了自我救赎……。未来某年的7月2日,美国各地的监视站发现一艘直径达数百英里的巨大飞船接近了地球。飞船发出的无线电信号干扰了地球的通信卫星信号,并放出了多艘直径达15英里的子飞船飞抵地球上各大城市的上空。外星飞船敌友未明,人们陷入了恐慌和迷惑。
电脑工程师戴维(杰夫•戈德布拉姆 饰)破译出外星人发出的无线电信号,其实是攻击的倒计时信号,他设法通知了前妻,总统的助理康妮,但是为时已晚,7月3日,外星人的飞船开始攻击地球,人类文明瞬间遭到巨大的打击和灾难。总统(比尔•普尔曼 饰)等人撤离到军事基地,指挥空军反击,却犹如以卵击石,毫无作用,军事基地也被摧毁,唯有飞行员史蒂文(威尔•史密斯 饰)设法诱使一架外星人战斗飞艇坠毁。
幸存者们逃到了秘密军事基地,在那里,科学家们一直在研究一艘50多年前坠毁的外星飞艇,致力于找出对付外星人的办法,那里也是人类最后的希望……。