延续前一集的剧情,狮子亚历克斯、斑马马蒂、长颈鹿迈尔曼、河马格洛里亚以及企鹅们,为了能离开马达加斯加岛回到五光十色的纽约,对一架破旧的失事飞机进行维修改造,并成功起飞。当大家已经开始庆祝终于可以回到纽约时,飞机却意外降落,迫降到了非洲大草原上。在这儿,狮子亚历克斯终于见到了它的父母。但是由于生活习性上太多不一样,而且言行举止各异,使得这群纽约来的动物们显得格格不入。这群昔日纽约中央公园的动物明星们,在这野外艰难的环境中应该怎么办?虽然在这儿遇见了自己的同类,但因为习性不同,使得自己无法完全融入他们的群体。为了能融入环境,与同类们建立良好的关系,大家都是施展各种招式,笑料百出。。龙门古镇,有一方恶霸戚正名,早年无恶不作,靠打家劫舍起家,后来与官府勾结,用卑鄙手段杀害了本地陈姓盐官,垄断了整个辖区的盐业。戚正名为人极为好色,连娶七房姨太太。可是近日里,戚府有些不太平,本来各自安好的姨太太们死伤不断,伴随着闹鬼的消息传开,人心惶惶,且正临迎娶八房姨太太在即,戚正名无奈之下唯有请来了两位“高人”前来捉鬼。
本以为闹鬼之事尘埃落定,不料戚老爷大婚当日,却暴毙在戚府的佛堂之下,死状可怖,所有人都将嫌疑锁定在了最后见到戚老爷的“高人”身上,戚府疑云成团,闹鬼之事再起,到底谁才是杀死戚老爷的真凶?。