被黑暗组织的人灌下毒药,身体变小了的高中生侦探工藤新一,化名为江户川柯南隐藏身份,并一直在暗地里调查黑暗组织的情报。知道他真正身份的有阿笠博士以及灰原哀。灰原哀实际上曾是黑暗组织的一员。但由于姐姐被杀,灰原哀想从组织脱离,也喝下毒药,以小学生的形象隐藏身份。
铃木集团的新饭店落成,受铃木集团大小姐铃木园子的邀请,柯南、小兰、阿笠博士,小哀等人都出席了宴会。宴会当中,吃了蛋糕的柯南和小哀发觉身体起了异常的变化。原来在蛋糕里,含有那种能让他们身体暂时恢复原样的酒精成分。柯南和小哀也因此变回了原本的样子……。影片开始是纪录片风格的打斗场面:一群蝎子跟老鼠对抗;接着呈现出游击队跟主教军的斗争;贯串全片多是违反一般常规的视觉形象,而自由的程度也大得惊人 :发怒的蝎子、维苏威火山喷出的熔岩和带有纪录性的场面;极端超现实场面、标新立异的场面交替出现:如一头母牛躺在一个年轻女孩的床上;基督变成了性虐待狂患者;作父亲的毫无感觉地开枪射杀自己的小孩,当仆人房舍起火,他却置之不理,甚至一辆牛车穿入房间,他也视若无睹;爱人们朝夕渴望相聚,但见面后却感到无所适从,只有进行集体损毁,将犁耙、长颈鹿、圣诞树焚烧;两个主教从楼上被仍了下来。更有甚者,一对爱人的眼睛被挤出,手被咬掉,在一条狭窄街道的碎石上翻滚着,同时可以听见艾吕声音唱到“爱情,爱情,爱情呀!”一种近乎神秘的爱情概念作为一种可以改变一切的,可以为人们赎罪的东西……。在繁华的都市背后,隐藏着一段不为人知的秘密。巨室大少爷封烨霆,曾是商界的风云人物,却因一场意外陷入深度昏迷,成为了植物人。三年过去,他依旧沉睡不醒,让封家上下都倍感焦虑。。